Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms