Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms