Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UIMC1Q96RL1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UIMC1Q96RL1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms