Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRERF1Q96PN7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRERF1Q96PN7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRERF1Q96PN7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRERF1Q96PN7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRERF1Q96PN7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRERF1Q96PN7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRERF1Q96PN7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRERF1Q96PN7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRERF1Q96PN7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRERF1Q96PN7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms