Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RNPC3Q96LT9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNPC3Q96LT9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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