Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAMP1Q96JM3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms