Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms