Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.6 ms