Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHFRQ96EP1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHFRQ96EP1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHFRQ96EP1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHFRQ96EP1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHFRQ96EP1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHFRQ96EP1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHFRQ96EP1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHFRQ96EP1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHFRQ96EP1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHFRQ96EP1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHFRQ96EP1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHFRQ96EP1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHFRQ96EP1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHFRQ96EP1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms