Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM19Q96E16 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM19Q96E16 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms