Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG4CQ96DT6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG4CQ96DT6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms