Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERP27Q96DN0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms