Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRIM63Q969Q1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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TRIM63Q969Q1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM63Q969Q1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM63Q969Q1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM63Q969Q1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM63Q969Q1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM63Q969Q1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM63Q969Q1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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TRIM63Q969Q1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM63Q969Q1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM63Q969Q1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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TRIM63Q969Q1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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TRIM63Q969Q1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TRIM63Q969Q1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TRIM63Q969Q1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM63Q969Q1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TRIM63Q969Q1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM63Q969Q1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TRIM63Q969Q1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRIM63Q969Q1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRIM63Q969Q1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRIM63Q969Q1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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TRIM63Q969Q1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM63Q969Q1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM63Q969Q1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM63Q969Q1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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TRIM63Q969Q1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM63Q969Q1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM63Q969Q1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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TRIM63Q969Q1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM63Q969Q1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM63Q969Q1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM63Q969Q1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM63Q969Q1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM63Q969Q1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM63Q969Q1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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