Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms