Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.41
DDX54Q8TDD1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms