Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM4Q8NFZ8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CADM4Q8NFZ8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms