Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE31

FAM13C, Protein FAM13C, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13CQ8NE31 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM13CQ8NE31 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM13CQ8NE31 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13CQ8NE31 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms