Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG8Q8ND04 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG8Q8ND04 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms