Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBR7Q8N806 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms