Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF148Q8N7C7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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