Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYBPQ8N488 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYBPQ8N488 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RYBPQ8N488 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms