Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP4Q8N3C7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms