Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRSK2Q8IWQ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRSK2Q8IWQ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms