Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC117Q8IWD4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC117Q8IWD4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC117Q8IWD4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC117Q8IWD4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC117Q8IWD4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC117Q8IWD4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms