Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29P2Q8IUI4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms