Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM25Q86YD3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM25Q86YD3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM25Q86YD3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM25Q86YD3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM25Q86YD3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM25Q86YD3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM25Q86YD3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms