Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VPS37DQ86XT2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37DQ86XT2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms