Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ5

SGMS1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1Q86VZ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGMS1Q86VZ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SGMS1Q86VZ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGMS1Q86VZ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGMS1Q86VZ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGMS1Q86VZ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGMS1Q86VZ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGMS1Q86VZ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGMS1Q86VZ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGMS1Q86VZ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGMS1Q86VZ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGMS1Q86VZ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGMS1Q86VZ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGMS1Q86VZ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGMS1Q86VZ5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGMS1Q86VZ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms