Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMC3Q7Z5M5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.2 ms