Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP54Q7Z3B4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms