Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRADAQ7RTN6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms