Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2AQ7L0J3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms