Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY3Q7L099 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY3Q7L099 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms