Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC80Q76M96 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms