Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TPTE2Q6XPS3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPTE2Q6XPS3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms