Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP12Q6UXS9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms