Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL17Q6UXB2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL17Q6UXB2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL17Q6UXB2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms