Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC171Q6TFL3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms