Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJP8

DCLRE1A, DNA cross-link repair 1A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1AQ6PJP8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLRE1AQ6PJP8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLRE1AQ6PJP8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLRE1AQ6PJP8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLRE1AQ6PJP8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLRE1AQ6PJP8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1AQ6PJP8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLRE1AQ6PJP8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms