Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDC42EP5Q6NZY7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC42EP5Q6NZY7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms