Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMBOX1Q6NT76 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms