Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INTS3Q68E01 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms