Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT79Q5XKE5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT79Q5XKE5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT79Q5XKE5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT79Q5XKE5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT79Q5XKE5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT79Q5XKE5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT79Q5XKE5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT79Q5XKE5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT79Q5XKE5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT79Q5XKE5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT79Q5XKE5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT79Q5XKE5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT79Q5XKE5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms