Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SUSD4Q5VX71 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms