Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFYVE27Q5T4F4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms