Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HABP4Q5JVS0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms