Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGO2Q562F6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms