Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAL1Q4LDG9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms