Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC27Q2M243 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC27Q2M243 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms