Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ISXQ2M1V0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms